UseGalaxy Canada permet l’accès gratuit à une infrastructure informatique de haute performance située au Canada via une interface Web intuitive. La plateforme offre des outils, des flux de travail et des ensembles de données de référence à la demande de la communauté de recherche canadienne, ce qui en fait l'endroit idéal pour effectuer des analyses.

Fonctionnalités

UseGalaxy Canada respecte les directives de mise en œuvre pour les serveurs internationaux UseGalaxy qui fournissent un ensemble commun d'outils et de génomes de référence ouverts à tous. À ce titre, UseGalaxy Canada vise à offrir les mêmes fonctionnalités de base que les quatres principaux serveurs UseGalaxy destinés aux communautés de recherche canadiennes et internationales. Parmi ces fonctionnalités, mentionnons :

• des milliers d'outils bio-informatiques (et provenant d’autres domaines) pour l'analyse et la visualisation;
• des centaines de génomes de référence et d'ensembles de données d'annotation fréquemment utilisés par la communauté;
• un système de flux de travail qui permet d'enchaîner les outils;
• le partage du contenu généré, par exemple les bibliothèques de données, les historiques d'utilisation, les flux de travail et les visualisations;
• de nombreuses formations en ligne.

L'initiative usegalaxy.*

Quatre autres grands serveurs UseGalaxy font partie de l'initiative usegalaxy.*. Galaxy Principal aux États-Unis (usegalaxy.org) Galaxy Europe (usegalaxy.eu), Galaxy Australia (usegalaxy.org.au) et Galaxy France (usegalaxy.fr). Ces serveurs constituent une ressource bio-informatique (couvrant également d’autres domaines) publique et incontournable à l’échelle mondiale. ils ont une apparence et une convivialité similaires; et sont dotés d’ensembles d'outils, de données de référence. Les serveurs de données sont distribués à l'échelle mondiale et le code est ouvert. Pour plus d'informations sur usegalaxy.* consultez le Galaxy Project Community Hub.

Vous pouvez demander l’ajout d'outils, de génomes de référence et de données d'annotation en utilisant ce formulaire.

Comment citer UseGalaxy Canada

Lorsque vous utilisez UseGalaxy Canada dans le cadre d’un projet, veuillez nous citer comme suit:

"Ce projet a bénéficié de la plateforme UseGalaxy Canada, un service fourni par la collaboration entre Calcul Québec (calculquebec.ca), l'Alliance de recherche numérique du Canada (alliancecan.ca), l'Université de Sherbrooke (usherbrooke.ca) et le projet Galaxy (galaxyproject.org)."